「てんかん支援拠点病院」は、てんかん診療を専門とする医師が在籍し、MRIやビデオ脳波などの必要な検査が可能であること、などの要件を満たす医療機関から、都道府県が指定します。
「てんかん支援拠点病院」は、医師、行政機関、てんかん患者や家族を含む、「てんかん治療医療連携協議会」を設置して事業を行います。具体的な活動としては、コーディネーターによる患者、家族への専門的な相談支援、他の医療機関や自治体、関係機関との連携、患者、家族、地域住民や医師への教育・啓発活動を行います。
現在、29都道府県で「てんかん支援拠点病院」が指定されています。（令和5年10月18日現在）
| 都道府県 | てんかん支援拠点病院名（リンク） |
|---|---|
| 北海道 | 札幌医科大学 |
| 宮城県 | 東北大学病院 |
| 茨城県 | 筑波大学附属病院 |
| 栃木県 | 自治医科大学附属病院 |
| 群馬県 | 独立行政法人国立病院機構 渋川医療センター |
| 埼玉県 | 埼玉医科大学病院 |
| 千葉県 | 千葉県循環器病センター |
| 東京都 | 国立精神・神経医療研究センター |
| 神奈川県 | 聖マリアンナ医科大学病院 |
| 新潟県 | 西新潟中央病院 |
| 石川県 | 浅ノ川総合病院 |
| 山梨県 | 山梨大学医学部附属病院 |
| 長野県 | 信州大学医学部附属病院 |
| 静岡県 | 静岡てんかん・神経医療センター |
| 愛知県 | 名古屋大学医学部附属病院 |
| 京都府 | 京都大学医学部附属病院 |
| 大阪府 | 大阪大学医学部附属病院 |
| 兵庫県 | 神戸大学医学部附属病院 |
| 奈良県 | 独立行政法人国立病院機構 奈良医療センター |
| 鳥取県 | 鳥取大学医学部附属病院 |
| 岡山県 | 岡山大学病院 |
| 広島県 | 広島大学病院 |
| 山口県 | 山口県立総合医療センター |
| 徳島県 | 徳島大学病院 |
| 福岡県 | 九州大学病院 |
| 長崎県 | 長崎医療センター |
| 大分県 | 大分大学医学部附属病院 |
| 鹿児島県 | 鹿児島大学病院 |
| 沖縄県 | 沖縄赤十字病院 |